25天!我国率先完成草地贪夜蛾染色体基因组测序和组装【马哥教育新闻快报433期】

各位小伙伴下午好,今天是2019年6月19日,这里是马哥教育新闻快报433期。

本期重点关注: 25天!我国率先完成草地贪夜蛾染色体基因组测序和组装

【快报内容】

1、 25天!我国率先完成草地贪夜蛾染色体基因组测序和组装

5 月中旬,一场与飞行速度争抢时间的科学研究也在接力进行。仅用 25 天,从害虫采样到论文发表,我国首次在全球完成对这种外来入侵者染色体级别的基因测序与组装。

  “草地贪夜蛾基因组的解读和深层次回答,对进一步研究其亚型、耐药性和长期防控具有重要意义。”中国科学院院士、华大基因学院院长杨焕明 18 日在昆明表示,入侵生物的耐毒性与遗传机制、确定入侵中国的样本类型、迁飞路线、基因防御技术、杂食性遗传机制等研究与应用,都离不开高质量参考基因组。

  华大生命科学研究院数字化地球研究所副所长刘欢介绍,从 5 月 21 日 13:00 接到任务指令到联系好采样,他们仅用时 30 分钟;两个小时后,确定了项目实施方案和样本来源。次日,他们在广州采到了样本,同时来自云南的样本送达深圳,当天就着手 DNA 提取等工作;第 5 天,就实现 stLFR 测序数据下机、5K 大片段和 WGS 上机测序以及转录组上机;第 10 天,完成了物种鉴定和第一版雌雄两个基因组组装;第 15 天,转录组数据下机,完成组装补洞和开始基因组注释;第 25 天——6 月 15 日,发布两个染色体水平的基因组,确定侵入我国草地贪夜蛾亚型和可能来源,文章正式在 BioRxiv 发表。

  “人类基因组测序六个国家参与、花了十年时间;其他物种的组装研究分析通常达到 1 年,算是快的。草地贪夜蛾的入侵,吹响了科研服务国家的号角,也让我们创造了前所未有的速度。”刘欢说。

  在杨焕明院士领导下,云南农业大学、华大基因、中国科学院动物研究所、中国农业科学院等通力协作,动用了所有资源,与国内各省区以及美国样本互动,产出了 1.5Tb 的基因组测序原始数据,目前完成了 1 雌 1 雄 2 个染色体水平的基因组组装,两个基因组组装大小分别达到了 542.42M 和 530.77M。

  “无论是基因组完整性还是基因集的完整性都超过了目前已有版本。”刘欢说,研究中通过基因注释共发现了 12516 个基因家族。通过与 8 个近缘鳞翅目物种进行比较基因组学分析,发现了多个扩张基因家族,其中有两个严重扩张,这意味着其在某些方面功能非常强,这或将为草地贪夜蛾的高度杂食性、抗药性研究打下基础。研究人员通过对草地贪夜蛾亚型分析表明中国种群有玉米型(C型)和杂合水稻型(R型)两种类型,确定有非洲入侵,不排除其他地区入侵。值得一提的是,项目组所使用的 stLFR 和 Hi-C 技术均为自主研发技术,达到了国际领先水平。

2、 苏姿丰谈接任AMD CEO职务后的顺利转型:专注于做正确的事情

2014 年 10 月,美国超威半导体公司(Advanced Micro Devices, Inc.)将苏姿丰博士(Dr. Lisa Su)任命为首席执行官,从此掀开了这家芯片公司的新时代。回顾这几年,Lisa Su 确实是一名出色的雇员,成功地将 AMD 从无关紧要的边缘带回了主流市场 —— 不仅让竞争对手英特尔对其刮目相看,还以超过 900% 的股价增长,让股东获利颇丰。

  她在近日接受 Barron’s 电话采访时称,其接任 CEO 的首要目标之一,就是“专注于正确的事情”。她认为高性能计算(HPC)会是一个巨大的市场,于是一直朝着这个的目标挺近。

  至于在技术上取得的成功,其认为一个重要原因是押注及时:

我们在 2015~2016 年间做出了相当重要的技术决策,正如 2018~2019 年的路线图所展示的那样。对 7nm 在内的各种技术的早期投入,让 AMD 在核心知识产权上打下了重要的基础。

  此外,决定不向哪些领域投资,也是相当重要的一点。

  苏姿丰表示,尽管 AMD 对许多领域都感兴趣,但若看不到成功的希望,他们是不会轻易去放手一搏的。

  显然,Lisa Su 对 AMD 的历史了然于胸,但她声称自己一直被非常棘手、难以解决的问题所吸引。

  坦率的说,在她接任 AMD 的时候,公司正陷于困境之中。其在与英特尔的竞争中失去了应有的地位,前景看起来一片黯淡。

  实际上,在早年身为 IBM 的一名年轻工程师期间,Lisa Su 就提出了一个如何解决问题的观点,因为“问题本身就可以创造机遇”。从为合作伙伴提供的市场机遇来看,没有比半导体行业更吸引人了。

3、 苹果Apple Watch逐渐独立 已经支持OTA无线升级

新浪数码讯 6 月 19 日上午消息,苹果公司似乎正在将 iPhone 与 Apple Watch 的关联度逐渐减小,最新 watchOS 已经支持手表独立 OTA 无线升级,而不再必须通过手机才能升级。

  此前,Apple Watch 如果进行升级系统,必须要通过与之配对的 iPhone 才可以。而在 watchOS 6 的第一版测试系统中,通用>软件更新设置下已经有了 OTA 选项。与 iPhone 一样,该机制会检查可用的系统更新,如果有了,它会直接下载到 Apple Watch 上。

  本周苹果向开发者发布 watchOS 6 的第二个测试版,这一机制开始发挥作用。也就是说,Apple Watch 终于接到了系统更新。

  不过目前这功能还是测试版,用户仍然必须使用 iPhone 来查看 watchOS 相关升级条款并点击接受。或许在 9 月 watchOS 6 正式版上线时候会有改变。

在手表上进行 OTA 升级存在的障碍可能是产品形态的不同,如果在 iPhone 上升级,万一失败,用户自己可通过 iTunes 恢复模式抢救回来。但 Apple Watch 的数据线接口特殊(隐藏在表带连接器内侧盖板里),这个接口以及与之匹配的数据线是专业人士才会用到的。

  在六月初刚刚结束的苹果 WWDC 全球开发者大会上,watchOS 6 正式发布,改进之一是有了自己独立的软件商店,这意味着它将越来越独立;实际这种过程在已经发布的四代手表上也一直在进行中,例如,2017 年推出的第三代 Apple Watch,就具备了 4G 网络和独立通话的能力,可以在不使用 iPhone 的情况下拨打更多电话。

4、 深网 | 对话拼多多百亿补贴项目宗辉:二选一不是最大的挑战

《深网》:拼多多的商户们怎么看 618 这种促销模式?

  宗辉:拼多多平台目前已有 360 万活跃商户,他们是拼多多的最坚实堡垒,也是我们服务消费者的重要神经元。

  在决定参与 618 促销节之前,我们曾和平台不同品类的商户都组织过一些座谈会。在座谈会上,他们提出了自己的部分诉求和担忧,第一,是不希望促销节变成了小商户们赔本替平台赚吆喝,第二,希望流量分配公正,避免此前其他电商平台出现的,流量只向部分玩家倾斜的情况。

  我们总结认为,拼多多商户们的核心诉求其实是两点,有利有义,既要能赚钱,又要规则公正。

  综合消费者和商家们的诉求,我们决定在今年 618 期间,由平台对消费者更需要的商品进行百亿补贴。关键词有两个,精准补贴,联合让利。

  首先,我们会根据平台大数据,指导商户们如何选品、备货,满足用户需求的热销商品,平台会与商户联合补贴让利。一旦商户的商品获得了用户认可,就能收获更多的补贴和流量。

  通过联合让利和精准补贴,我们希望帮助商户把价格优势转化为规模优势,从过去追求高客单价的经营思维,转换为追求规模效益、积累优质客户的互联网思维上来。

  这一套做法现在看已经逐渐收获了成果。618 期间,我们经过对比消费者数据后,对一款国行博世(BOSE)降噪耳机进行了精准补贴,补贴价比正品价便宜了快 1000 元,结果消费者反应太热烈,导致平台的零售商面临巨大的供应压力,有一家商户甚至连夜紧急补货 6 次。最后,在平台和多个商户的共同努力下,才彻底解决了供应量问题。

  其实,过去之所以有些商户对于电商节又爱又恨,原因是他们的经营成本太高,而平台的流量分配规则是“按照品牌商权重”来分,导致对于大量有能力为消费者服务的商户,在促销节中尽管也付出成本参与让利,最终却没有得到合理的流量和客户。

  而拼多多平台通过今年的百亿精准补贴,正是为了解决了这一问题,最终结果证明,对于我们的新规则新玩法,商户们也是支持和满意的,我们很可能会把这一模式继续推广下去,成为与商户合作的一个常用模式。

  通过这次 618,我们得到的宝贵经验是,不能把促销节变成了品牌商之间的博弈,而要想办法把大家的主要精力,放在如何满足用户需求、提供消费者最急需的商品上来。因为让消费者用脚投票,永远都是最公平的平台规则。

【今日学习必备】

【Linux面试真题】- 如何让history命令显示具体时间?

shell> HISTTIMEFORMAT=”%Y-%m-%d %H:%M:%S”

shell> export HISTTIMEFORMAT

重新开机后会还原,可以写/etc/profile

【Python面试真题】- 请写一个Python逻辑,计算一个文件中的大写字母数量!

请写一个Python逻辑,计算一个文件中的大写字母数量
>>> import os

>>> os.chdir('C:\\Users\\lifei\\Desktop')
>>> with open('Today.txt') as today:
    count=0
    for i in today.read():
        if i.isupper():
            count+=1
print(count)

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>【就业喜讯】

【学员喜讯-841期】- Python18期学员—8K到2W 的提升,绝对逆袭!

5天!我国率先完成草地贪夜蛾染色体基因组测序和组装【马哥教育新闻快报433期】"

【近期开班】

Linux面授班:2019年7月15日(北京)
Linux网络班:2019年6月22日(网络)
Python面授班:2019年7月22日(北京)
Python网络班:2019年7月13日(网络)



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